Высшим руководящим органом Союза является Общее Собрание Участников Ассоциации «Национальный Оконный Союз» (в Общих Собраниях с правом совещательного голоса могут принимать участие представители компаний отрасли СПК, представители государственных, муниципальных органов и других общественных организаций - любые заинтересованные лица);

Постоянно действующий коллегиальный исполнительный орган — Правление Ассоциации, избранный на период с 13 марта 2023 года по 14 апреля 2024 года:
— Шуров В.Ю. - Председатель Правления
— Мухов Н.А.
— Паредес Д.А.
Орган, осуществляющий контроль за финансово-хозяйственной деятельностью Ассоциации Ревизионная комиссия:
— Ириков А.И. - Председатель Ревизионной комиссии
— Лазарев А.А.
— Василенко Н.А.

Единоличный Исполнительный орган Ассоциации - Директор Шаповалова А.А.