Высшим руководящим органом Союза является Общее Собрание Участников Ассоциации «Национальный Оконный Союз» (в Общих Собраниях с правом совещательного голоса могут принимать участие представители компаний отрасли СПК, представители государственных, муниципальных органов и других общественных организаций - любые заинтересованные лица);

Постоянно действующий коллегиальный исполнительный орган — Правление Ассоциации,
избранный на период с 22 апреля 2024 года по 21 апреля 2025 года:
— Шуров В.Ю. - Председатель Правления
— Бегишев С.В.
— Паредес Д.А.
Орган, осуществляющий контроль за финансово-хозяйственной деятельностью Ассоциации Ревизионная комиссия:
— Ириков А.И. - Председатель Ревизионной комиссии
— Гладков П.С.
— Лазарев А.А.

Единоличный Исполнительный орган Ассоциации - Директор Шаповалова А.А.